Fue creada en el año 1995, por iniciativa del Director (e) Rafael Díaz
VERDE: En forma horizontal está representada la fertilidad de la región, la biodiversidad de la flora y fauna.
BLANCO: Representa la pureza, la belleza, la armonía y la convivencia de la comunidad.
Fue creado por un grupo de profesores, estudiantes y padres de familia en el año 1995 y luego fue modificado por el Licenciado Fidel Gandía, su forma tridimensional en todas sus direcciones, se compone de:
AMARILLO: Significa la riqueza del saber
VERDE: Representa la naturaleza, el espacio socio-ambiental en el cual está inmerso el municipio de la Apartada.
AZUL: Representa la riqueza hídrica
BLANCO: Representa la armonía, la paz y la convivencia de los símbolos.
ANTORCHA ENCENDIDA: Estar en permanente búsqueda del conocimiento, avanzar, transformar, emprender.
PENDONES DE COLOR AMARILLO: Representada con tres palabras fundamentales de izquierda a derecha: CIENCIA, AMBIENTE Y LIBERTAD las cuales nos significan:
CIENCIA: Aplicabilidad del conocimiento experimental y pedagógico.
AMBIENTE: Identificación del contexto institucional, producción, preservación y sostenibilidad.
LIBERTAD: Representa la justicia, la democracia y la aplicación de los valores.